恐龙灭绝的原因有许多种说法。有科学家认为，恐龙灭绝或是由外星人造成的。外星人在地球上实施了一次大爆炸，这场大爆炸带来的严重灾灭绝了恐龙。
外星人或是在地球进行核试验，也可能只是单纯的想入侵。但目前并没有发现任何外星人骨骼化石，或者是外星人的废弃物，这种说法只好作罢。
古生物学家巴伦-弗朗茨-诺普乔(Baron Franz Nopcsa)认为，恐龙腺体过度活跃不正常，并且出现较低的欲望需求，从而导致它们的种群数量骤减。
其他科学家则指出，体型较大的饥饿毛毛虫，外星人，以及恐龙喜好吃恐龙蛋，最终一些因素导致恐龙灭绝消失。目前多数科学家表示，火山活动、气候变化以及超大质量小行星碰撞地球，可能最终导致恐龙灭绝。
诺普乔曾在20世纪初提出了一些关于恐龙灭绝的解释理论，其中包括：恐龙具有较低的性需求，腺体过度活跃不正常。这位思维敏锐的古生物学家认为，恐龙脑垂体腺的分泌物导致恐龙的体型很大。
美国史密森尼学会报道称，然而，当他试着将类似的条件应用于人类时，并没有证据表明脑垂体腺分泌物与体型或者物种灭绝有任何联系。
一位研究员指出恐龙喜好吞食恐龙蛋，这种自相残杀导致它们灭绝消失。同时期科学家乔治-维兰德(George Wieland)认为，恐龙自相残杀导致灭绝，霸王龙是首个朝向巨大症发育的实例，它们以蜥脚类动物的恐龙蛋为食。耶鲁大学研究员指出，这种贪婪的食肉动物吃了大量的恐龙蛋，从而导致恐龙物种灭绝。
现代科学家表示，虽然化石证据显示霸王龙喜欢吃恐龙蛋，但是它们无法将所有恐龙蛋都吞食。聚焦于恐龙蛋化石，上世纪70年代化石专家H.K.埃尔本(H.K. Erben)提出，恐龙蛋具有多层壳质，其中一些壳层非常薄，易于过早破碎，从而导致处于发展中的小恐龙出现窒息或者脱水。
虽然H.K. 埃尔本支持法国南部发现的恐龙蛋壳化石证据，然而该化石显示这是一种局域性现象，而不是全球性现象。20世纪初，当达尔文的物竞天择论开始盛行时，许多古生物学家猜测恐龙过于行动迟缓、体型较大和愚蠢，无法正常运行其身体机理功能。
主流观点认为是超级小行星碰撞地球导致恐龙灭绝。目前，一种认可度较低的理论认为恐龙具有进化惰性，在体型变大方面消耗了大量能量，而不是变得更加聪明，尽管事实上一些较大体型的恐龙仍兴旺繁殖，例如：剑龙和腕龙。
在近十年内，一位不育症专家猜测恐龙灭绝是由于它们无法找到配偶，谢尔曼-西尔柏(Sherman Silber)称，温度可决定一些动物的性别，例如：鳄鱼，伴随着气候变化，可形成单一性别的新生恐龙。该理论存在着许多漏洞，其中科学家并不知道是否恐龙的性别是受温度影响。
上世纪60年代，昆虫学家斯坦利-佛兰德斯(Stanley Flanders)提出，地球白垩纪时期，最早的飞蛾和毛毛虫原始物种吞食所有的植物。
因此，他推断认为恐龙这支庞大的掠食性物种将变得非常饥饿，没有更多的植物供恐龙食用。然而，现代科学和化石记录再一次推翻了恐龙灭绝解释论，科学家证实蝴蝶和飞蛾与恐龙和谐共处，它们并未完全吞食所有植物。
此外，眼科专家L.R.-克罗夫特(L.R. Croft)认为，较差的视力导致恐龙灭绝消失。上世纪80年代，他提出升温导致恐龙白内障日趋恶化，暗示着恐龙面部进化形成角状结构是为了保护眼睛被太阳灼伤，但是该理论无法适用于飞行恐龙。
科学家还猜测某颗近地超新星爆炸，向地球大气层释放X射线，导致全球温度显著降低，最终酿成恐龙灭绝悲剧。但迄今为止并未发现近地超新星爆炸的证据。
恐龙灭绝从一定程度上来说是必然的，他庞大的身躯已经无法适应新的环境，必然会被淘汰。生物只有不断进化，才能摆脱灭绝的厄运。