其实，不仅仅是在政治上，在一些宗教传播的过程中，各种势力的争斗同样错综复杂。发生在光绪二十一年六月十一日，福建省古田县的古田教案就是其中的一个缩影。
时间回溯到1892年。这一年，刘祥兴、柳阿七在福建古田创立斋会。所谓的斋会，也叫“斋教派”。斋教派起源于波斯人摩尼于公元三世纪创立的摩尼教，在公元七世纪传入中国，也称明教。对，就是张无忌当教主的明教。摩尼教的教义提倡素食、戒酒、裸葬，因而被视为“吃菜事摩(尼)教”。这种不受官方待见的宗教，被人们称之为“吃菜事魔教”。摩尼教在民间秘密流传的期间，渐渐演变成了斋教。
在初创的三年间，二人合力发展的会众竟然达到了三千余人。到了1895年，刘祥兴等人想要发动起义，却被古田的英美传教士知晓。毕竟清政府已经快成了外国人的办事员，帝国主义可不想换人来统治中国。于是传教士便向英美驻福州领事汇报，领事又向闽浙总督边宝泉作了提醒。
得到消息的边宝泉立即派兵前往镇压。刘祥兴只好提前行动，立即发动斋会群众把矛头指向了告密的外国传教士。
8月1日这一天，古田传教士居住的花山外，聚集了三百多名斋会会众。在刘祥兴的号召下，三百多名会众开始围攻修道院。
8月1日清晨，斋会成员闯入传教士的山庄内，对还在睡梦中的外国人砍砍杀杀。之后，会众又进行了一番抢掠，最后将两栋房屋焚毁。
直到这次暴力事件结束，一共有11名英国传教士死亡，受伤的则有5人，另外还烧毁2栋房子。
据被抓的刘祥兴交代，原本此次暴乱共有三个计划，第一个是攻打古田县城。第二个是攻打安樟村富户。第三个是攻击外国传教士。
不过让人感到无语的是，原本集结了三百余人的队伍，到了花山只剩下了十几人。其余的人呢，全都跑到了山里面，准备迎接胜利的好消息。
古田教案发生后，英国首先发表了强烈谴责。英国方面要求清政府将古田县杀害传教士的凶手严厉惩办，并请清政府极力保护外国传教士的在华安全。
由于英、美领事在交涉中无理挟制和一些荒唐的要求，清政府一共处决了25人，外加20人遭到了严惩。新任英使又要求清政府对一些曾参与教案的民众严加调查。因为这个原因，关于古田教案的议赔事宜一直未能解决。
后来，英国政府认为古田教案将会对中英关系产生不良影响，于是指示驻华大使迅速结案。光绪二十二年(1896年)五月初三，英使照会总理衙门：“兹准本国外务大臣来电，以该教会不肯受赔等因，准此，相应照会贵大臣查照，此案即可了结矣。”
奇怪的是，这次结案并不像之前列强所作的那样，要赔钱了事。《南京条约》中约定赔款2100万。《辛丑条约》中约定，中国从海关银等关税中拿出4亿5千万两白银赔偿各国，并以各国货币汇率结算，按4%的年息，分39年还清。
可能是英国人怕夜长梦多，所以才暂时收手。至此，古田教案这一义和团起义前最严重的教案结束，而它也成为了福建教案史上罕见的、造成重大损失而没有经济赔偿的教案。