蒙家军行军在沙漠中，却出现内奸扎破营中所有水桶，蒙恬料定是赵高要置蒙家军于死地。田伍长等人自认守卫失职，要按军法自我处置，小川劝他们将尊严和生命等同视之，并保证会为他们洗脱罪名。
蒙家军的兵将因为干渴倒下不少，蒙恬飞鸽传书向学生李由求援。小川按奈不住，向蒙恬提出建议，蒙恬却打断他，除非小川接任蒙家军，否则他不会听小川的任何建议。
小川怒责蒙恬置三万士兵性命于不顾，蒙恬提醒小川，如果全体三十万蒙家军将来因群龙无首而覆灭，国门被戎狄、匈奴踏破，二千万人就将生活在水深火热之中，玉漱公主也一样要遭受流落之苦，被人糟蹋。与之相比，这只是小数目。
蒙恬终于牵着小川的手向众将士宣布，他就是自己失散多年的弟弟蒙毅，蒙家军今后的新统帅，并将随自己征战多年的盔甲传给了蒙毅。蒙毅利用沙漠的昼夜温差教士兵们变出了“天水”，威信大增。为了快速制胜，蒙毅派田伍长用苦肉计混入敌营，一面又让士兵们躺在地上诈装奄奄一息。
戎狄果然中计，以为可一举获胜，于是倾巢出动，却陷入秦军埋伏，转头却发现兵营也被一把火烧毁，田伍长拿下了首领帕甲阔的首级。戎狄慌乱溃逃，蒙毅却命令麾下停止追击，蒙恬不解，他告诉蒙恬，自己的战术是擒贼擒王而不是大开杀戒。
神话第32集剧情介绍李由驰援赶到之时，军中已开始举行庆功宴。蒙恬告诉李由自己将不久于人世，请他不要就自己遇刺一事责问父亲李斯，并全力帮助蒙毅。大殿上秦皇大悦，封赏蒙毅位上卿，辅佐蒙恬总揽军务，正式接手了蒙家军。
李斯与赵高不满，窃议要在其和丽妃头上做文章，好一箭双雕除去二人。小月出宫为玉漱捎话，见到了蒙毅的女仆德香大吃一惊。蒙恬送给蒙毅一批良驹，蒙毅想起自己曾经向大哥项羽许下的诺言，命庞副将将良驹送去会稽，这便是日后的乌骓。
蒙府上，挂起了一面半烧焦的旗帜，这是蒙家时代忠良与荣耀的见证……蒙毅托小月将自己的分手告白交给小月。不料小月在宫门被太监截住。陈永厉在小月身上搜出手机交给赵高，赵高发现了小川和玉漱的秘密。
大殿上，秦皇将蒙毅，玉漱同招来，赵高启奏，蒙毅暗中勾结丽妃，并且要呈上真凭实据。 赵高得意洋洋打开手机呈到秦皇面前，手机却没电了。他气急败坏地问蒙毅要充电器，蒙毅装作什么也不懂。赵高情急，令人押上小月，要她供出两人奸情。
小月为了保护小川，竟供认自己违反宫规，爱上了蒙毅，才出宫探望。秦皇对赵高十分不满，令他自己按宫规处置妹妹，廷杖百下，逐出皇宫。小月被打得死去活来。赵高痛哭流涕，向秦皇苦苦哀求，秦皇丝毫不为所动。玉漱和蒙毅站出求情，秦皇这才放过小月。