杨林派人前来请丁延平前去中军帐议事方才结了罗成之围。罗成知丁延平定是去商议守阵之事，便一同前往，却被高明、高亮拦了下来，杨林出帐告诉罗成，因罗成经验尚浅，故派他丁延平同守一阵，主帅为丁延平，罗成任先锋，故不用参与守阵商议之事。罗成只得悻悻而归。
红拂女想要逃跑未遂，李世民转而又生一计，前去见靠山王杨林。正在李世民面见杨林之时，李靖叫醒李元霸，李元霸杀出重围，在外宣称若是不放李世民等人，他将投奔反王，与隋军为敌。杨林迫于李元霸的压力，只得后退一步，放李世民等人，以平此事端，红拂女赶往晋阳。
程咬金等得不耐烦，与齐国愿一起撺掇李密夜探铜旗阵，却正遇四宝大将尚师徒。秦琼知魏王等人前去探阵，追去救驾，与尚师徒恶战一番，竟枪折马死，幸好罗士信来得及时，才救他一命。待秦琼回到营中，众人知黄骠马已死，不禁大为悲痛。徐茂公怒斥程咬金，魏王、秦琼为程咬金求情，徐茂公方才放过程咬金。
罗成夜盗阵图，被丁延平发现。罗成劝丁延平弃暗投明，丁延平则坚持忠心不侍二主，断不能做不忠不义之事。罗成对丁延平言自己愿为拿出阵图付出性命，二人约定若是罗成能够踏出此门，便算罗成赢，他将不再阻拦。罗成与丁延平战在一处，不分胜负，难舍难分。
开唐元勋第54集剧情介绍罗成与丁延平交手，罗成胜出携阵图离开，丁延平拔剑自刎，罗成洒泪而去，将阵图交予魏王，并提议从阵图所示玄武阵直攻而入。秦琼等人则担心罗成会因此暴露，定会连累北平王府而不应允。此时，李世民前来，表明反隋之心，为天下谋太平之志，想要加入反王，一同作战。众人当下商议决定从宇文成都所守白虎阵攻入。
未等瓦岗之人通知，刘大朋、韩猛、韩勇、谢天豹四名反王为私欲所怂恿，擅自闯阵，惨死阵中，全军覆没。魏王下令攻破白虎阵，与宇文成都一场恶斗，幸好李元霸来得及时，牵制住宇文成都。各反王趁乱冲入阵中，以夺铜旗。数家反王为夺铜旗而自相残杀，此时杨林率军而出，围剿反王，与反王战在一处。白虎阵，瓦岗军还在与隋军作战，伤亡惨重。尤俊达为救程咬金被射中。而杨林不敌反王围攻，战死沙场，秦琼拿得铜旗，被人拥戴着前往扬州行宫去换金镶玉玺。
杨广得知靠山王已死，心中愤恨，不明白为何天下人反他，于是下令定要杀掉所有逆反之人。杨广将一盒子交予宇文化及，称盒中便有玉玺，命宇文化及把盒子送出，换与夺得铜旗之人。秦用代父拿铜旗换玉玺，不料盒中竟暗藏毒箭，秦用惨死当场，秦琼悲痛，情绪难抑。众人激愤，欲冲进行宫，杀奸臣、诛昏君，为死去的弟兄报仇。
开唐元勋第55集剧情介绍正当诸位英雄要冲进行宫之时，不料却从行宫四周冒出许多军队来，与剩余反王军队恶战一番。然李元霸在打斗之时被击头部，开始癫狂，竟杀起自己人来。王伯当在徐茂公的指挥下，箭射其气穴，李元霸无声倒下。秦琼率领众人终杀退最后的隋军来到行宫门口。罗士信将宫门撞开，却被门内乱箭射死，战场之相，惨不忍睹。秦琼怕伤亡过重，命人撤退。
罗成告别父亲，随秦琼回瓦岗，准备重整旗鼓，再战隋朝。罗艺则回北平府。
杨广损兵折将，手中已无兵权，自知死期降至，感慨颇多。宇文化及操控军队，软禁杨广，更要除掉北平王。宇文化及、宇文成都率兵半路截杀罗艺，罗艺惨死宇文成都手下。宇文父子，赶往北平府，欲夺北平府之兵权。罗松带王妃逃走，被宇文化及拦下，罗松、王妃俱死于宇文父子手下。宇文化及既得北平府兵权，下一步便要除掉杨广，逼他交出玉玺。罗成预感家中有事，急忙往回赶，却发现满门皆死，难以消受，更被宇文成都手下抓住，押往扬州。
夏王窦建德得知铜旗阵一役，隋军与反王皆是损失严重，此时正是他渔翁得利之时，于是同女儿窦线娘一起直下扬州，夺取玉玺，逐鹿中原。途中，正遇隋军押罗成前往扬州，于是出手相救，不想正遇秦琼等人也来相救。双方合力将罗成救出。窦建德与程咬金商议，一同前去扬州，除掉昏君。
开唐元勋第56集剧情介绍窦线娘为受伤的罗成送药，处处表示关怀之意，单盈盈有些吃醋。
杨广观琼花，忽一阵邪风吹来，琼花飘零，杨广深感扫兴，此时令狐行达来报，请杨广还朝。
杨广趋至殿中，却见众臣相逼，杨广质问众人为何反他，众臣言是为百姓反。宇文化及前来，杀死杨广之子杨杲、爱妃朱贵儿，逼迫杨广。杨广悬梁自尽。宇文成都不肯随父取得玉玺，反而杀出寝宫，以报圣恩。宇文成都被李元霸所杀，顿时天地迷蒙，忽降大雨，李元霸举锤欲砸死雷公，却将自己砸死。
萧后将玉玺交予宇文化及，想要随宇文化及一起逃走，不料半路杀出程咬金，程咬金杀死宇文化及，夺得玉玺。窦建德则将萧后带回宫中。秦琼率兵攻入行宫，隋朝彻底瓦解。与此同时，李渊率兵起义，攻占长安
李建成、李元吉怂恿父亲出兵瓦岗，夺回玉玺。李世民认为当下之计不在玉玺之争，而在招兵买马，壮大实力。李渊听从李世民之计。瓦岗既得玉玺，单雄信则以为应立即号令天下，直攻长安，徐茂公等人则认为时机未到。然而，李密深夜召唤王伯当，命王伯当用玉玺换得萧后，王伯当不解，但答应为他办妥此事。
程咬金、裴翠云则在为罗成、单盈盈张罗婚事，罗成态度不明，再加上窦线娘此时来到瓦岗，单盈盈以为罗成变心，不解罗成心思，心中十分郁闷。