秦始皇姓嬴名政，出生于战国时代的赵国首都邯郸（今河北邯郸市）。他的父亲子异（后改名为子楚），是在邯郸做人质的秦国公子。他的母亲是出生于邯郸豪门大户的舞姬，史书上没有留下她的名字，只称她为赵姬。子异和赵姬的相遇结合，其间有一位第三者介入。这位第三者，就是吕不韦，在邯郸经商的大富豪。正是由于吕不韦介入子异和赵姬之间的缘故，嬴政出生以后，他的生父究竟是谁，是子异还是吕不韦？也就成为一桩说不明白的事情。生父不明，对于一般的庶民百姓而言，是一桩难言的家事；对于家天下的皇室而言，可就是一桩关系王朝命运的国事了。这关系到六百余年世代承继的秦国政权，究竟还姓不姓嬴，秦国是否在秦王嬴政即位时，就已易姓革了命？因为如此事关重大，秦始皇的生父究竟是谁的问题，不但成为秦国历史上一个迷雾重重的谜，也成为历史学上一桩千古聚讼的公案，更成为两千年来人们茶余饭后的谈资。
考究事情的来龙去脉，这桩公案起源于《史记》，换句话说，都是司马迁惹的祸。司马迁在《史记·秦始皇本纪》中叙述秦始皇的身世说：秦始皇是秦庄襄王子异的儿子。庄襄王作为人质在赵国时，在吕不韦家遇到赵姬，一见钟情，娶以为妻，生下了秦始皇。出生的时间是秦昭王四十八年（公元前259年）正月，出生地是邯郸。
然而，司马迁在《史记·吕不韦列传》里叙秦始皇的出生时说：吕不韦与绝色善舞的邯郸美人赵姬同居，知道赵姬有了身孕。子异到吕不韦家作客宴饮，见到赵姬而一见钟情，起身敬酒，请求吕不韦将赵姬送与自己。吕不韦开始非常生气，后来考虑到自己已经为子异的政治前途投入了大部分财产，为了“钓奇”获取投资的成功，他不得不顺水推舟，将赵姬送与子异。赵姬隐瞒了自己已有身孕，嫁与子异如期生下了嬴政。子异于是立赵姬为自己的夫人。
同一《史记》的不同篇章当中，对于同一事情有不同的记事，这就是谁是秦始皇父亲之问题的由来，宛若司马迁为我们布下的迷魂阵。那么，这两种不同的记事，究竟哪一个对，哪一个错？哪一个是历史的真相，哪一个是人为的虚构呢？
父亲子异的态度
从嬴政出生开始，一直到嬴政继承王位为止，子异从来没有对嬴政是自己的儿子有过任何怀疑。他始终一贯地承认他是自己的长子。
我们暂时将断定秦始皇的生父究竟是子异还是吕不韦的问题放下，先来搜寻旁证，着眼于事件的当事人。
我们首先来考察子异。子异是秦国第32代王孝文王的儿子，名子异。子异出生于他的祖父秦昭王在位的第27年，相当于公元前280年。他后来继承王位，做了秦国第33代王，谥号庄襄王。大概是在子异18岁时，也就是秦昭王四十三年（公元前264年）左右，秦国和赵国定约和好，互相交换王室子弟以为人质，子异以王孙的身份来到赵国首都邯郸做人质，被称为质子。子异在邯郸时，正是长平之战爆发前夜，秦赵两国为了争夺一统天下的主导权，表面定约言和，背地里扩军备战，准备决一死战，因而，子异在邯郸的处境非常窘困。子异与吕不韦结识，大概是在到邯郸后的二三年间，他从吕不韦那里得到赵姬并同居，是在秦昭王四十七年（公元前260年）三月以前。秦昭王四十八年正月，嬴政出生。当时，子异23岁。
就在赵姬怀嬴政的当年，也就是秦昭王四十七年（公元前260年），秦赵长平之战爆发，赵国大败，四十万赵国降军被秦将白起活埋，邯郸恐慌震惊。次年，秦军乘胜攻入赵国境内。秦昭王四十九年，秦军开始长期围困邯郸。嬴政在战乱中出生以后，子异一家陷入赵人仇恨的汪洋大海中，随时有不测的危险。秦昭王五十年，吕不韦和子异冒险逃出邯郸，回到秦国，赵姬和三岁的嬴政留在邯郸，被赵人仇恨追捕，九死一生，依靠赵姬家人的掩藏，得以幸免于难。回到秦国的子异，正式做了王太子安国君的继承人，另外娶妻生子。当时，嬴政4岁，与母亲一道隐藏在邯郸，音信不明。
昭王五十六年（公元前251年），秦昭王去世，嬴政的祖父安国君即位做了秦王，是为孝文王。以此为契机，秦国与赵国和解，赵国将赵姬和嬴政送还秦国。子异与赵姬和嬴政母子离别六年重逢，夫妻父子间生离死别的感动，依人情不难想见。已经正式做了王太子的子异，以赵姬为太子正妻，以嬴政为太子继承人，对发妻和长子，作了不忘本的交代。当时，嬴政9岁。
孝文王即位时已经五十多岁，正式即位三天就去世了。子异接替王位做了秦王，是为庄襄王。庄襄王即位以后，赵姬成为王后，11岁的嬴政成为王太子，吕不韦被任命为丞相。三年以后，庄襄王死去，13岁的嬴政继承王位，赵姬成为王太后，吕不韦继续留任丞相。由于嬴政尚未成年，政权由母后和吕不韦摄理。
通过以上的简单梳理，我们可以清楚地看到，从嬴政的出生开始，一直到嬴政继承王位为止，子异从来没有对嬴政是自己的儿子有过任何怀疑，反倒是在历经了长期的生离死别，另外娶妻生子以后，对赵姬和嬴政厚爱有加，始终一贯地承认他们是自己的正妻和长子。在复杂的秦国王室和政府内部，在王室联姻的敌友各国之间，也都不见有任何质疑的动静，听不到任何流言飞语。至此时为止，秦国的国事、秦王的家事，一切井井有条，顺理成章。也就是说，如果我们从秦国王政和父亲子异的角度来加以考察的话，直到嬴政即位成为第34代秦王为止，谁是秦始皇的父亲的问题，在历史上根本就不存在。
仲父吕不韦的动机
吕不韦不但没有作案的动机，只有避嫌唯恐不及的谨慎。所谓献有孕之姬以钓奇的风闻，只能是坊间留言，后世添加花絮。
吕不韦被秦始皇尊为仲父，也就是仅次于父亲的父辈，他是涉嫌谁是秦始皇生父的另一位嫌疑人。如果我们历史地考察吕不韦的一生，并不难看出他与嬴政的关系。吕不韦是濮阳人，濮阳是当时卫国的首都，故址在现在的河南省濮阳市南。吕不韦出身商贾世家，从事国际贸易大获成功，被称为阳翟大贾。阳翟在今天的河南省禹县，是韩国的旧都。所谓阳翟大贾，用我们今天的话来说，就是总部在阳翟的商界大鳄。吕不韦到赵国首都邯郸做生意遇见子异，马上以商人精明的眼光，敏锐地察觉出子异特殊的商品价值，以为奇货可居。经过深思熟虑和周密计划，吕不韦大胆地做了事业和人生转型的决断。他毅然决然将生意清盘兑现，整个地投资于子异的政治前途，他包装打造子异、公关游说安国君的正妻华阳夫人，目的在于使子异成为王太子安国君的继承人，将来继承王位，可谓是最高风险的投资。
如果说吕不韦视子异为奇货可居的金蛋，在他那无与伦比的商业眼光里，华阳夫人就是孵蛋器。吕不韦投资子异以后，华阳夫人成为他的公关对象。华阳夫人出生于秦国最有权势的芈氏外戚家族，她的祖父，是秦昭王的舅舅，被封为华阳君的权臣芈戎，华阳夫人的称号，就是直接从华阳君继承下来的。华阳君芈戎的姐姐是秦昭王的母亲，安国君的祖母，也就是多年秉持秦国国政的宣太后，一位秦国的慈禧太后。华阳夫人嫁于安国君，是亲上加亲的政治婚姻，安国君之所以能够立为王太子，多多仰仗了宣太后和芈氏家族的力量。以后的事态发展，一步步都在吕不韦的预计和操控当中。吕不韦以质子子异之使者的身份，携珠宝重金来到咸阳，首先买通说动华阳夫人的兄弟姐妹，通过他们的协作疏通，游说华阳夫人成功。华阳夫人认领子异为自己的养子，再在枕边吹风，使安国君正式立子异为王太子继承人。
可见，一、吕不韦成功地将互惠互补，双赢共利的商业原则运用于政治，通过连环套式的投资计划，促成了子异与华阳夫人联手合作，在王权争夺中胜出，最终取得秦国政权。二、吕不韦游说华阳夫人使子异成为王太子继承人的历史事件，表面上看来复杂而富有戏剧性，其实质是嬴姓某系王子与芈氏外戚之间再次缔结政治同盟。三、子异的王室血统问题，是整个事件的关键。在吕不韦看来，子异的投资价值，全在于他的王室血脉。吕不韦游说华阳夫人，他的卖点也全在子异的王室血统。
吕不韦可以说是中国历史上第一等的智慧人物。他将自己的所有财产和整个人生都投资到子异的政治前途上。吕不韦的行动，宛若孤注一掷的豪赌，全部赌注都压在子异所独有的秦王王室的血统之上。纯正的秦王血统，正是奇货可居的本质，也是决定吕不韦行动的根本利害所在。对于吕不韦来说，维护秦王血统的纯正和可信，是他不敢有稍许怠慢的死活问题。
历史人物的活动，自有其当时当地的动机。在我们将谁是秦始皇的父亲之问题作为一桩历史公案来审理的时候，如果我们视吕不韦为嫌疑人的话，可以说，他不但没有作案的动机，他只有避嫌唯恐不及的谨慎。所谓献有孕之姬以钓奇的风闻，只能是坊间的留言，后世添加的花絮，不但与一位大商人、大政治家的行为完全不符，而且毫无实现的可能。
以上综上所述，我们通过可能是秦始皇父亲的两位嫌疑人的审查，大概可以得到以下结论：从嬴政的出生一直到他即位，从来没有人怀疑过他是否是子异的儿子。也就是说，谁是秦始皇的父亲之谜，从秦始皇的出生一直到他即位，是不存在的。而后世添加的流言更不是历史的原貌。