编者按:本文来自微信大众号“量子位”(ID:QbitAI),作者十三 边策,36氪经授权发布。
新冠疫情在美国日益严重,怎样办怎样办?
华盛顿大学的科学家们,预备发动群众、依靠群众,用古里古怪汪洋大海蓬首垢面的才智群智群力。
所以这款名为Foldit的益智免费游戏,火了。参加参加能够构建一种蛋白质,来阻挠新冠病毒进犯人类细胞。
并且游戏是在线的,结束后假如发生了有期望抗击病毒的效果,那么华盛顿大学蛋白质规划的科学家们,就会拿这些效果去做测验,复兴是制作蛋白质!
Foldit确实为科研做出过实践奉献。
Nature杂志在2010年还点名表彰过这款游戏,由于参加其间的5.7万名玩家为科学家们供给了济济一堂的效果,这些效果复兴比某些核算机算法还要好。
现在,怀有解救国际之心的20万游戏玩家,没收在分秒必争奉献力量。
依据Foldit的描绘,当冠状病毒外表上那些尖尖的东西(刺突蛋白),和人类细胞外表的受体蛋白严密结合时,病毒就会形成感染。
而最近几周的研讨,没收确认了新冠病毒刺突蛋白的结构,以及它是怎样与人类受体结合。
因而,Foldit就期望经过这样的游戏,来寻觅一种蛋白质,然后阻挠新冠病毒感染人类细胞。
那么这个游戏详细怎样玩?
38个关卡,逐渐应战构建蛋白质
Foldit支撑Windows、Mac和Linux三个操作系统,游戏下载装置分外的简略(地址在文末)。
装置、注册结束后,就来到了它的初始界面。
中心上下摇摆的深红色刺状球体,便是冠状病毒,两头橘色和蓝色则是蛋白质侧链。
游戏的玩法,是经过鼠标改动蛋白质侧链 (Sidechain)和骨架 (backbone)以及其它一些列杂乱结构的方位,来消除病毒。
Foldit 一共设置38个关卡。
第一关,你要用鼠标拖动这两个侧链的方位,消除病毒,并让分数到达7700分。
第二关展现了蛋白质骨架,有时蛋白质骨架间隔过于附近,因而,咱们在这一关需求拖动蛋白质骨架来移动方位,但一起还需求确保它们之间的严密结构,分数需求到达6500分。
相同,第三关也是需求移动蛋白质侧链来到达方针分数。
从第四关开端,就很杂乱了,不只需拖动每个蛋白质侧链方位来消除病毒,还需求移动到恰当的视点来到达方针分数。
但从第四关开端就会解锁一个辅佐功用“Shake”,能够一键让侧链摆到抱负方位。
有时,蛋白质骨架的间隔又太远,就会呈现“空泛”,此刻就需求将蛋白质骨架的间隔拉近一些。
与此一起,还需求确保不再发生病毒,这便是游戏的第五关。
到了第六关,又会解锁一个强壮的东西——Wiggle,能够一键进步蛋白质骨架结构。
点击“Wiggle”键后,蛋白质骨架方位就会渐渐改动,分数的进度条也在增加,直到分数到达方针值,使命也就完成了!
下一关开端,为了让进步分数,还会触及到蛋白质中的氢键 (hydrogen bond)的操作。
当下图中上下两个“sheet”方位接近时,它们之间就会发生蓝白相间的条形状物质,这便是氢键。
越往后的关卡会触及更多杂乱的结构,比方处理疏水性(hydrophobic)侧链问题、匹配“sheet”等等。
当然,在闯关的时分,肯定会遇到各式各样扎手的问题。
别急!Foldit的在线形式,能让你实时和其他玩家沟通(招待是你的英文需求先过关……)。
游戏官网上,还展现了分数靠前的集体、个人等排名,假如你的效果解救了国际, 不怕没人知道。
现在,游戏没收招引了20万用户,其间名为Go Science团队,在集体或个人的排名方面都比较突出。
为何要研讨蛋白质折叠?
免疫系统中的抗体是一种特别的蛋白质,它经过特定形状的折叠结构,能够捉住对应的某一种病毒。
假如能搞清楚抗体的结构,就能更好的帮忙咱们区抵挡新冠病毒。
冠状病毒的特点是它外表上有一种刺突蛋白,蛋白与人类细胞外表上的一种受体蛋白严密结合,帮忙病毒进入人体细胞。
一旦冠状病毒刺突与人类受体结合,病毒便能够感染人类细胞并仿制。
现在研讨人员没收确认,新式冠状病毒和SARS病毒都是经过刺突蛋白(S蛋白)与人体ACE2受体结合。
假如咱们我们能够规划与这种冠状病毒刺突蛋白结合的蛋白,就可拿来阻挠与人体细胞的相互作用并阻挠感染。
所以Foldit最近增加了一个新的关卡,把科学家最新研讨效果的什物加入到游戏中。
游戏里蛋白质的骨架和大部分侧链都被彻底固定。玩家需求在此基础上规划一种与侧链结合的新蛋白质,然后阻挠病毒与人类受体的相互作用。
为了结合冠状病毒靶标,玩家需求在结合位点与刺突蛋白规划许多接触点以及氢键,使蛋白质能正确折叠。
玩家规划出的结构能够提交到社群内,供其他玩家复兴是科学家参阅。几乎便是死宅们愿望的游戏解救国际。
买游戏机也能抗疫
其实,不只玩PC游戏能为抗病毒做出奉献,买游戏机回来放着不玩也能的。
斯坦福大学的Pande实验室为蛋白质折叠的研讨,开宣布Folding@Home方案:用核算机模仿蛋白质分子的折叠。
游戏机当然也能估核算机——假如一台游戏机的算力不行,就把全国际几千万玩家联合起来。
参加Folding@Home项目的公司还有索尼、英伟达等等。到这儿相信你也能猜到了,没错,便是索尼的PS游戏机!
2006年,索尼和斯坦福大学协作,共同在PS3上推出了Folding@Home应用程序。只需玩家不在玩游戏,PS3就会使用搁置资源来核算。
核算蛋白质的折叠更依赖于GPU算力,而其时的PS3游戏机在图形方面的算力名列前茅,复兴超越许多台式机,因而也更适合用来核算蛋白质折叠问题。
更凶猛的是,PS3还具有将数据快速传输到GPU的才能,终究在屏幕上显示出实时的原子级蛋白质动力学可视化效果。
2012年11月,索尼烟消云散了在PS3上对Folding@home的支撑。
在它6年的生命周期中,一共超越1500万用户下载了这款应用程序,为它奉献了超越1亿小时的核算时刻,极大地帮忙了与蛋白质相关的疾病研讨。
One More Thing
当然,关于“抗疫”游戏,今日还有一件事备受争议。
瘟疫公司在国内App Store下架后,现在呈现了一款与之类似的国产游戏“疫情解药”,但网友很快发现:它从界面和玩法上都和瘟疫公司高度类似。
有山寨嫌疑不说,价格也遭到争议,比瘟疫公司高出许多:每周98元、主动续订。
也便是说,假如你忘了撤销,那么这个游戏玩一个月就要花掉400元。
也可能是考虑到价格太高,这款游戏现在推出了3折限时优惠活动。
但是即便如此,如此行径和吃相,让许多业界外网友都看不下去:
所以相比之下,Foldit就显得更良知且公益。
彻底免费,还能为研讨蛋白质做出一些细小的作业。
你怎样看?
传送门
游戏下载地址:https://fold.it/portal/node/2008926
Folding@Home项目:https://foldingathome.org/
参阅链接:https://venturebeat.com/2020/03/03/coronavirus-inspires-university-of-washington-to-create-protein-folding-puzzle-game/